Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOL3O95236 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOL3O95236 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL3O95236 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL3O95236 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms