Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CLSTN1O94985 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLSTN1O94985 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms