Protein–RNA interactions for Protein: O75969

AKAP3, A-kinase anchor protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP3O75969 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AKAP3O75969 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AKAP3O75969 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AKAP3O75969 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
AKAP3O75969 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AKAP3O75969 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms