Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCNKO75909 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCNKO75909 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms