Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOK4-215ENST00000569010 1060 ntTSL 516.87■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOK4-217ENST00000569538 558 ntTSL 416.2■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOK4-208ENST00000566588 564 ntTSL 415.8■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOK4-211ENST00000567175 539 ntTSL 415.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOK4-205ENST00000562737 920 ntTSL 514.43□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ITPR1-207ENST00000467056 1483 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOK4-204ENST00000562008 495 ntTSL 312.37□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 SMAP1-203ENST00000370455 3333 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOK4-212ENST00000567214 579 ntTSL 411.19□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ACTN1-213ENST00000554508 585 ntTSL 49.56□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ZSWIM8-205ENST00000433366 5773 ntTSL 516.96■□□□□ 0.313e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 DOT1L-205ENST00000478937 638 ntTSL 314.66□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 ANKS1A-202ENST00000470698 957 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 159.4
SF3B1O75533 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 515.05■□□□□ -03e-6■■■■■ 159.2
SF3B1O75533 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 313.64□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 159.2
SF3B1O75533 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.53e-6■■■■■ 159.2
SF3B1O75533 SLC25A13-203ENST00000472162 568 ntTSL 417.98■□□□□ 0.475e-8■■■■■ 158.9
SF3B1O75533 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71e-6■■■■■ 158.9
SF3B1O75533 NPL-209ENST00000471010 518 ntTSL 317.4■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 158.5
SF3B1O75533 NPL-203ENST00000367553 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 158.5
SF3B1O75533 MSI2-210ENST00000579505 577 ntTSL 319.3■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 158.5
SF3B1O75533 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 158.4
SF3B1O75533 NRBP2-209ENST00000533093 3877 ntTSL 1 (best)17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 158.4
SF3B1O75533 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 158.4
SF3B1O75533 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.223e-6■■■■■ 158.2
SF3B1O75533 CREB1-206ENST00000432329 7650 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 158.2
SF3B1O75533 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 158.2
SF3B1O75533 MAP2K2-209ENST00000600584 2926 ntTSL 215.65■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 158.1
SF3B1O75533 MAP2K2-206ENST00000597263 552 ntTSL 310.68□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 158.1
SF3B1O75533 TEX10-201ENST00000374902 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 158.1
SF3B1O75533 TEX10-204ENST00000535814 3006 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.832e-7■■■■■ 158.1
SF3B1O75533 MAP2K2-207ENST00000599021 314 ntTSL 59.21□□□□□ -0.944e-6■■■■■ 158.1
SF3B1O75533 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.852e-15■■■■■ 158
SF3B1O75533 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 158
SF3B1O75533 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 158
SF3B1O75533 C16orf72-202ENST00000574285 10359 ntTSL 25.7□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 158
SF3B1O75533 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 157.8
SF3B1O75533 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 157.7
SF3B1O75533 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 157.7
SF3B1O75533 GALNT10-210ENST00000521786 600 ntTSL 329.48■■■□□ 2.312e-6■■■■■ 157.6
SF3B1O75533 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.389e-7■■■■■ 157.5
SF3B1O75533 GTF2IRD1-204ENST00000470715 824 ntTSL 311.08□□□□□ -0.642e-7■■■■■ 157.5
SF3B1O75533 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.972e-7■■■■■ 157.3
SF3B1O75533 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 157.3
SF3B1O75533 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 157.3
SF3B1O75533 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 157.3
SF3B1O75533 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 157.3
SF3B1O75533 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 157.2
SF3B1O75533 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 157.1
SF3B1O75533 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 157.1
SF3B1O75533 ASCC3-201ENST00000324696 3618 ntTSL 213.27□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 157.1
SF3B1O75533 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.625e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SPRED3-206ENST00000587947 646 ntTSL 324.86■■□□□ 1.574e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.414e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.34e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 ARVCF-211ENST00000495096 2549 ntTSL 219.79■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 LETM1-202ENST00000466175 1626 ntTSL 218.98■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.625e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 PC-207ENST00000528403 706 ntTSL 218.14■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 LETM1-206ENST00000512189 320 ntTSL 316.31■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 515.78■□□□□ 0.125e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SMURF2-207ENST00000585301 1716 ntTSL 515.25■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 PC-212ENST00000531614 690 ntTSL 514.46□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 CIZ1-227ENST00000634501 1996 ntTSL 514.14□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 TPCN2-207ENST00000637084 4622 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.195e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SMURF2-203ENST00000578386 3104 ntTSL 1 (best)10.61□□□□□ -0.714e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 PC-202ENST00000393958 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 PC-203ENST00000393960 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.794e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 PC-201ENST00000393955 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 SMURF2-206ENST00000582081 5892 ntTSL 56.95□□□□□ -1.34e-6■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 WDR20-219ENST00000559708 563 ntTSL 36.71□□□□□ -1.349e-8■■■■■ 156.9
SF3B1O75533 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 213.79□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 156.8
SF3B1O75533 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 156.8
SF3B1O75533 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 156.7
SF3B1O75533 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -12e-6■■■■■ 156.7
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1229.3 ms