Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPFIA4O75335 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PPFIA4O75335 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms