Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NIPSNAP2O75323 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NIPSNAP2O75323 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms