Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SIN3BO75182 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SIN3BO75182 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms