Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIA3O75145 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIA3O75145 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms