Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HTATSF1O43719 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HTATSF1O43719 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HTATSF1O43719 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms