Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSTPIP1O43586 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms