Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBFA2T2O43439 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBFA2T2O43439 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms