Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CRXO43186 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CRXO43186 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CRXO43186 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CRXO43186 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CRXO43186 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRXO43186 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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