Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KDM6AO15550 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KDM6AO15550 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM6AO15550 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms