Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RNF113AO15541 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RNF113AO15541 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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