Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTLC1O15269 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTLC1O15269 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms