Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CLGNO14967 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CLGNO14967 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CLGNO14967 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CLGNO14967 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLGNO14967 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLGNO14967 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CLGNO14967 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CLGNO14967 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CLGNO14967 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLGNO14967 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLGNO14967 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLGNO14967 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLGNO14967 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CLGNO14967 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CLGNO14967 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms