Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IFIT3O14879 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFIT3O14879 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms