Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHD1O14646 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHD1O14646 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHD1O14646 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHD1O14646 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHD1O14646 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHD1O14646 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHD1O14646 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHD1O14646 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHD1O14646 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHD1O14646 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CHD1O14646 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHD1O14646 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHD1O14646 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHD1O14646 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHD1O14646 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CHD1O14646 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHD1O14646 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHD1O14646 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHD1O14646 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHD1O14646 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHD1O14646 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHD1O14646 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHD1O14646 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CHD1O14646 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CHD1O14646 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CHD1O14646 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CHD1O14646 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
CHD1O14646 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CHD1O14646 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CHD1O14646 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CHD1O14646 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CHD1O14646 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHD1O14646 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHD1O14646 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHD1O14646 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHD1O14646 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHD1O14646 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHD1O14646 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CHD1O14646 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHD1O14646 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms