Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HSPB6O14558 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSPB6O14558 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms