Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE40O14503 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BHLHE40O14503 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms