Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TAF4O00268 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TAF4O00268 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4O00268 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4O00268 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TAF4O00268 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TAF4O00268 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TAF4O00268 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TAF4O00268 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms