Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMAPO00193 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMAPO00193 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMAPO00193 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMAPO00193 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMAPO00193 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMAPO00193 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms