Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC4-APOC2K7ER74 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms