Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
J3KT08 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
J3KT08 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
J3KT08 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
J3KT08 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
J3KT08 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms