Protein–RNA interactions for Protein: C9JCJ5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JCJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9JCJ5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9JCJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9JCJ5 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9JCJ5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C9JCJ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9JCJ5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9JCJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9JCJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9JCJ5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9JCJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms