Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM1B2RUZ4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM1B2RUZ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms