Protein–RNA interactions for Protein: A6PVS8

LRRIQ3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ3A6PVS8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ3A6PVS8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRIQ3A6PVS8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms