Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HELTA6NFD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HELTA6NFD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms