Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POTEFA5A3E0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POTEFA5A3E0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms