Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
XIRP2A4UGR9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
XIRP2A4UGR9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms