Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM30A4D0T7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM30A4D0T7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms