Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VWA8A3KMH1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA8A3KMH1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms