Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
SSPOA2VEC9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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