Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC66A2RUB6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC66A2RUB6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms