Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A1W2PPC1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A1W2PPC1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms