Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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