Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
A3GALT2U3KPV4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
A3GALT2U3KPV4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms