Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD54BQ9Y620 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAD54BQ9Y620 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms