Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFG3L2Q9Y4W6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFG3L2Q9Y4W6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms