Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C8

UFC1, Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFC1Q9Y3C8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UFC1Q9Y3C8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
UFC1Q9Y3C8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms