Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NOD1Q9Y239 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NOD1Q9Y239 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms