Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ERVW-1Q9UQF0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ERVW-1Q9UQF0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms