Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHA12Q9UN75 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHA12Q9UN75 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms