Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC9Q9UKV0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC9Q9UKV0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms