Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGA1Q9UJY5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA1Q9UJY5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms