Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DUSP13Q9UII6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUSP13Q9UII6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms