Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DNAI1Q9UI46 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNAI1Q9UI46 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms