Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPXQ9UHP9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms