Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCF2Q9UG63 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCF2Q9UG63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms